В центре сюжета мультфильма "Нимона" находится необычная история о девушке по имени Нимона, которая превращается в подружку злодея и вместе с ним пытается совершить различные преступления. Однако по мере развития событий выясняется, что мир не такой простой, каким его представляла Нимона, и она начинает задаваться вопросами о своем месте в этом мире. В процессе она понимает, что добро и зло далеко не всегда имеют четкие границы и что люди зачастую способны на самые неожиданные поступки. Нимона вынуждена решить, на чьей ей стороне быть, когда окажется в самом эпицентре борьбы между героями и злодеями.